少数病人服用灵芝后会出现轻微不适反应，如胃潮、咽干、便秘、不易入睡等，个别的会出现鼻出血，出现这种情况可不必介意，这同有些人吃辣椒，生姜出现口干、咽痛反应一样，继续服用，不适反应自会消失，个别反应严重的可暂停服用。
破壁后的灵芝孢子粉更容易被子人体吸收到它的有效成份。破壁孢子粉(破壁率大于98%)的粗蛋白、总糖及锌、铜、铁、硒等微量元素的含量变化不大：此外，包括牛磺酸在内的多种游离氨基酸含量也没有明显的变化。破壁后孢子粉的脂肪及水溶性多糖的含量分别比未破壁的提高了38.95%和21.83%。其他的研究也表明，破壁孢子粉中的还原糖和多肽较不破壁孢子粉易于提取，而巳得到的有效物质含量明显提高;更为重要的是，破壁孢子粉醇提液比不破壁孢子粉具有更强的体外毒杀癌细胞的活性。
灵芝不同于一般药物只对某一方面营养素的不足进行补充和强化，而是在整体上双向调节人体功能平衡，调动机体内部活力，调节人体新陈代谢功能，提高机体免疫能力，促使内脏或器官功能正常化。中医认为，灵芝入五脏，补益全身五脏之气。所以无论心、肝、肾脏虚弱，均可服之。
服用破壁灵芝孢子粉的注意事项主要为：
1、有极少数人对灵芝有过敏，这类人就不宜吃灵芝。
2、还有灵芝在以下情况是不建议使用的：病人手术前、后一周内，或正在大出血的病人。
3、服用灵芝无效之原因。正常的情况服用1-2周后即有改善的表现，继续服用则可让身体恢复健康。
